Svi na palubu za avanturu otoka s Mariom i Luigijem! Braća se vraćaju u potpuno novoj avanturi na visokim morima! Krenite na putovanje s Mariom i Luigijem na otoku Shipshape (dio broda, dio otoka) i putujte kroz ogroman svijet Concordije. Iskoristite top broda Shipshape kako biste posjetili, istražili i krenuli u potragu kroz otoke koji se protežu od tropskih prašuma do živahnih gradova. Upoznajte nove prijatelje na putu, poput Connie i Snoutleta (koji definitivno nije svinja), i susretnite se s poznatim likovima iz Kraljevstva gljiva poput Peach i Bowsera, koji vam mogu pomoći na vašem putovanju! Morate se osloniti na bratsku vezu Marija i Luigija kako biste uspjeli. Koristite Bros. poteze kako biste prevladali prepreke dok istražujete i snažne Bros. napade u dinamičnom obratu na borbu temeljenu na potezima. Trebat će vam svaka prednost koju će vam ovaj 'brod braće' dati kako biste spasili dan!